As comissões hospitalares são formadas por profissionais técnicos, como médicos e enfermeiros.
Essas comissões são de fundamental importância para a gestão da instituição hospitalar e contribuem para a formulação de políticas, coordenação e monitoramento do hospital.
O Hospital Santa Paula possuí 8 comissões, todas engajadas para melhorar os trâmites internos e assim melhorar o atendimento ao paciente.